孤岛地图位于游戏主世界的中心区域，是玩家初始接触的核心生存场景。该地图以史前生态为背景，包含丛林、沼泽、雪山、海洋等多种地形，陆地面积约63平方公里，气候系统模拟了昼夜交替与极端天气。孤岛地图的坐标体系采用经纬度标记，重要区域如克拉格岛（南方半岛）坐标为东经80.3、北纬53.5，此处因草食性恐龙聚集且威胁等级低，常被推荐作为新手起始点。
孤岛的资源分布呈现明显的地域特征。南方丛林与西部走廊富含基础生存物资如浆果、木材与燧石，但缺乏金属矿等高级资源；中部红树林区域存在可采集树脂的特殊树种，需使用专用树脂龙头装置。金属矿脉集中分布于北部火山与雪山地带，而黑曜石、水晶仅存在于特定矿洞内部。海洋区域包含四个海底矿洞，需配备潜水装备或沧龙等水生坐骑才能探索，半深海区可获取珍珠与黑珍珠。
矿洞系统是孤岛的核心挑战区域，共包含10个陆地矿洞与4个海底矿洞。中央洞穴（41.5X46.因极端寒冷需携带火把与血包，毒气矿洞（62.5X36.要求防毒面具或琥珀免疫状态。矿洞内普遍存在100级以上的蝎子、蜘蛛等生物，部分矿洞需搭建桥梁通过岩浆地形。所有矿洞均产出特定神器，如猎手神器位于南二矿洞（80.3X53.，用于召唤监察者BOSS。
驯养体系在孤岛生存中占据关键地位。初级阶段建议驯服渡渡鸟与副栉龙过渡，无齿翼龙作为首个飞行坐骑需使用流星锤控制。中后期可建造3×3地基的驯龙船，配合石头门框困住南方巨兽龙等高级生物。风神翼龙驯服需利用老鹰将其逼入水域后射晕，鱿鱼则需在半深海区用沧龙辅助喂食黑珍珠。所有驯服行为受驯养有效性机制影响，击晕后遭受攻击将大幅降低属性加成。
飞升任务是孤岛剧情的终极目标，需集齐全部神器并在监察者平台召唤BOSS。实际战斗难点在于前往BOSS路径上的高等级生物群，可采用隐身状态规避。监察者战需准备泰克装备与高伤武器，其技能包括召唤腐蚀生物与范围电击，森林泰坦与沙漠泰坦对其有额外伤害加成。胜利后角色将获得飞升状态，解锁基因编码中的特殊能力。
