研究基地是古墓丽影9中一个关键场景，包含解谜、战斗和收集要素。要顺利通过这一区域，需要掌握升降梯操作、敌人清理和隐藏物品收集的技巧。进入研究基地后，首先需要启动升降梯。在二层启动控制台，但升降梯会被卡住。
这时需要撬掉三个滑轮才能让升降梯正常运行。第一个滑轮在右侧箱子上方，用攀爬斧撬掉后，升降梯会下降一段距离。从窗口爬出，打开铁门方便后续行动。接着上到三层，启动控制台让升降梯上升，然后跳到对面平台。
基地内有不少巡逻的士兵，躲在箱子后观察他们的移动路线，逐个解决能减少正面冲突。屋内有两名士兵在交谈，可以趁他们分开时逐一射杀。注意烧掉墙上的宗教旗帜，这是挑战任务太阳杀手的一部分，总共需要击落五只图腾。
在办公室的桌上可以找到文档士兵：觉醒，走廊天花板上挂着一只图腾，透过窗户还能看到对面房间的另一只。跳进窗户落到底层能拾取秘宝，而遗物周朝战盔和祭典头盔位于有水区域的铁门后，需要用榴弹炸开铁门才能拿到。完成所有目标后，升降梯会降落到一层，打开通道进入下一区域。
