支线古墓是游戏核心探索内容之一，共有9座隐藏古墓分布在不同区域。每座古墓设计有独特机关谜题，完成挑战后可获得技能奖励或稀有资源。进入古墓前需确保携带足够箭矢、燃烧瓶等工具，部分场景需利用环境互动解谜，例如冰船古墓需通过调节水位改变浮力，而太阳系仪古墓则需破解天体运行规律。古墓内部通常包含多层结构，需反复观察地形与机关联动关系，生存本能键（右摇杆按压）可高亮关键交互点。
解谜过程中需灵活运用劳拉的工具组合。绳索箭矢可搭建滑索或拉动重物，钩斧能攀附特定墙面或破坏脆弱结构。例如冰河洞穴古墓需用绳索箭矢固定浮冰形成通路，而地热山谷的古墓则依赖钩斧凿开岩层。部分谜题需结合物理机制，如利用水流冲击转动轮盘，或借助风力推动悬浮平台。战斗并非古墓主旋律，但偶尔会遇到守护者，建议优先学习死从天降技能实现高处暗杀。
独石碑需通过提升语言熟练度破译，解锁后地图会标记钱币秘宝位置；壁画和文献则补充剧情背景，建议全部阅读以提升探索完成度。部分古墓设有限时挑战，如审判凝视需在倒计时内完成滑车联动，可提前规划路径并预判操作节奏。若卡关可暂时退出，在营地升级装备后再尝试。
最终谜题通常需要综合运用环境与工具。以灵魂之室古墓为例，需先点燃四角火盆激活中央装置，再调整镜面反射光线点燃主火炬。部分场景存在视觉误导，如看似无法窄缝实则暗藏可破坏墙体。完成所有古墓挑战不仅能解锁古墓征服者成就，更能获得永久增益技能，例如提升资源采集效率或增强武器伤害，对主线推进有显著帮助。
